患者长期服用十一酸睾酮软胶囊可能会导致胃肠道功能紊乱、性早熟、精子质量下降等危害，可以通过服用药物的方式进行治疗。

1、胃肠道功能紊乱：十一酸睾酮软胶囊主要用于治疗雄激素缺乏症，如果患者长期服用，可能会导致胃肠功能出现紊乱的情况，严重时会引起胃胀、胃痛等症状。患者可以遵医嘱服用双歧杆菌活菌散、盐酸美贝维林片等药物进行治疗，可以促进胃肠道蠕动，有利于改善症状。

2、性早熟：由于十一酸睾酮软胶囊属于激素用药，如果青春期长期大量服用，可能就会导致性早熟的情况，患者可以遵医嘱使用炔雌醇环丙孕酮片、注射用醋酸亮丙瑞林等药物进行治疗，能够抑制性早熟的情况。

3、精子质量低：部分患者在长期服用十一酸睾酮软胶囊后，如果剂量过大，还可能会出现精子质量低的情况，患者可以遵医嘱服用生精胶囊、金锁固精丸等药物进行治疗，能够提高精子活力。

除以上常见危害外，还有其他的危害，如肝功能受损。患者出现上述症状时，需要及时就医，通过胃肠道功能动力学、肝功能、性激素六项等检查，明确病情发展情况，然后积极展开治疗。患者在治疗期间要注意多休息，适当进行体育运动，如跳绳、慢跑等，能够提高身体素质。