尖锐湿疣潜伏期3周到8个月，平均3个月，病程经过缓慢，通常无全身症状。多数患者一般无自觉症状，临床表现多种多样，皮肤损害大小及形状不等，数目少则数个，多则十余个、数十个以至百个之多。初起为细小淡红色或皮色丘疹，后逐渐增大增多相互融合，表面凹凸不平，湿润柔软，融合呈乳头样，鸡冠样或菜花样增生物，有时疣体可呈现条索状或指状，根部常有蒂，可糜烂渗液，易出血，可有瘙痒感、灼痛和恶臭，搔抓后可继发感染。部分病人感到阴部瘙痒，性交时疼痛或出血。少数病人疣体过度增生，成为巨大型尖锐湿疣，可恶变为癌肿。当妊娠期体内激素水平变化，机体免疫功能下降，生殖器疣的体积可迅速增大，甚至阻塞产道。男性患者好发于冠状沟、包皮、包皮系带、尿道口、阴囊和肛门周围。女性常侵犯犬阴唇、小阴唇系带、尿道口、阴道口、阴道、宫颈等处。少数病人可出现生殖器肛门以外的尖锐湿疣，如足趾缝间等处。此外尚有亚临床感染状态，是指临床上肉眼看不出的病变，表现为很微小或外观正常的病损，但用3%～5% 醋酸液局部外涂5～10 分钟可使感染区域发白，即所谓“醋酸白现象”。