男性阴茎短小可能是包皮过长导致的，有可能是身体内缺乏激素引起的，当出现肾虚或者是长时间手淫的时候也会出现阴茎短小的情况。出现阴茎短小的时候需要到医院做一个全面性的检查，看一下是否有睾酮水平不正常症状。平时要避免生气和着急。

这和遗传有很大的关系。发育与营养状况，一般来说，成年男性体格健壮，身材高大，其外生殖器包括阴茎、阴囊的发育也较好，阴茎可能较为粗大，反之则可能小一些。