有时可进行痰（从肺部咳出）培养或检查，以查看能否找到细菌或病毒。而需要住院的患者，常常需要针对其最可能的病毒和细菌，进行更多的此类检查。如果患者的病情没有好转、感染严重，或存在少见感染的高风险，其可能还需通过一种被称为纤维支气管镜检查的操作，来进行肺部痰标本的采集。