主要根源于压抑在潜意识内的某些本能欲望、意念、情感、矛盾情绪与精神创伤等因素的作祟。这些被压抑的东西，虽然人们自己不能觉察，但在潜意识内并不安分守己，而是不断兴风作浪，从而引起患者自己也不理解的焦虑、紧张、恐惧、抑郁与烦躁不安，并产生各种精神障碍表现。有些精神分裂症、躁郁症与偏执性精神病的精神病性症状，也可以通过精神分析，从其潜意识的心理机制方面获得较深的理解。