双侧附睾头囊肿影响生育，严重的话可能会引起男性不育症的出现。附睾囊肿的原因可能由于局部炎症粘连使附睾管阻塞，或者其中微小单一的附睾输精管阻塞后管腔液潴留，形成囊肿。附睾囊肿会引起精子质量、精子活力和精子数量急剧下降，引发男性不育症，是会影响怀孕的。