新生儿便秘的症状主要表现为大便体积小、干燥坚硬、呈卵石状(即使每天仍有排便)，伴有排便困难、排便疼痛、无休止的哭闹。大便表面有血，大便从肛门溢出，排便时间长，用力过度，腹痛腹胀，多疑疲倦，食欲不振。患有严重便秘的婴儿甚至有肛裂。肛裂的发生使婴儿有排便的恐惧，害怕上厕所，造成恶性循环，随着时间的推移，可能会导致腹部胀痛、厌食、睡眠不安等症状。