临床上凡遇到不明原因的发热、恶液质（恶病质），或者原因不明的肝脾淋巴结肿大，或者末梢血涂片里出现异常幼稚细胞，或者其它异常细胞，血细胞中的白细胞、血小板、红细胞不明原因增多、减少等症状，多怀疑是造血系统疾病，要做骨髓穿刺检查。另外，非造血系统疾病，如黑热病、疟疾或者转移瘤，可以通过骨髓穿刺找到特殊性物质以明确诊断，这些病人也需要做骨髓穿刺检查。另外，造血系统疾病，在诊断和治疗过程中，为了观察治疗效果，也需要做骨髓穿刺活检检查。