肛周脓肿只要形成了，就应该立刻切开排脓，控制继续的感染，阻止脓肿向深部组织蔓延和扩散，同时配合全身和局部肛周脓肿的治疗，以减轻病人痛苦，创口长期不能闭合，常有脓水流出，很痛苦，检查时发现已成为肛瘘，这是因为脓肿自行破溃或切开后，原发内口感染物不断从内口进入感染灶，形成长期的炎症刺激及反复感染，最终导致肛瘘。