丹参酮一般不会有副作用，但是也可能存在一些个体差异。丹参酮胶囊里面所含有的有效成分主要就是丹参，毒理研究之后发现，丹参并不具有任何的毒性，因此在临床上使用过后没有发现任何的副作用。每一个人可能会存在个体差异，有百分之一的人群在服用过后可能会出现头胀头晕脸部潮红等副作用，也有不少的人群会出现胃肠不适。