进行了磨腮骨手术以后是会有后遗症的，主要有：1、手术过程中可能会出现操作失误的意外情况，这些失误主要包括有器械划伤自身组织、神经、血管，这就会引发较大的后遗症，导致组织受损、神经受损以及血管被破坏等现象；2、磨骨容易引发骨折，特别是关节部位。当存在骨折问题时，可引发行动能力受限、肌肉受损，情况严重者可能还会出现瘫痪的后遗症。