肛瘘手术需要一个半月到两个月左右的恢复时间，如果是采用比较传统的手术方式因操作较为简单恢复时间也很短。甚至对于比较浅的肛瘘来说，术后恢复期可能不到一个月。如果是用全新的手术治疗方式，用新材料作为填充物的话，恢复时间会提前十天左右。