肛周脓肿的主要形成的原因是肛门感染。感染分为两种类型第一种是腺性感染，是因为细菌等感染因子扩散到周围形成脓肿。约80%-85%的肛周脓肿是腺性感染。第二种类型被称为非腺源性感染。分为局部或全身性，如局部毛囊炎、汗腺发炎或囊肿感染；因意外跌倒或抓伤，导致肛门周围组织或肌肉感染，形成肛周脓肿。