先天性甲状腺功能减退的患者，越早治疗越好。新生儿疾病筛查的逐步发展，使患者可以在出生后1-3周内得到诊断和治疗。如果出生时明显存在低宫内甲状腺功能减退症，例如骨龄明显延迟，甲状腺激素水平低，甲状腺缺陷等，则对智商的影响非常危险，遗传性神经系统后遗症很大，需要及早治疗。