出现慢性腹泻后可以吃磺胺类药物，该类药物有很好的止泻疗效，不过服药时最好遵听医嘱。如果腹泻情况比较严重，则可以应用吸附性止泻药。另外，因细菌、真菌引起的慢性腹泻，可服用抗生素来抑菌杀菌，达到治疗目的。而中药上可以服用人参健脾丸、六君子丸、附子理中丸等中成药来治疗慢性腹泻。

小儿慢性腹泻的病程一般会持续两个月左右，还有的患儿可能不会持续性的腹泻，但每次发作间隔时间都在两到四周不等。患儿每次病情发作时，都会表现为大便次数增加、大便性状稀薄，且伴随有腹痛、肚脐胀痛的症状。而导致慢性腹泻病程延长的原因，主要是原发病未能及时控制有关。

慢性腹泻患者在日常生活中可以多喝白粥，适当的吃一些水果，尤其是苹果和石榴，还应该多吃容易消化的食物，例如面食，但是在制作的过程中不要煮得太过于油腻和辛辣，否则会加重肠胃复担。除此之外，还可以制作栗子粥和菱粉粥，对治疗慢性腹泻有很好的辅助效果。

慢性腹泻一般会导致大便次数明显增多，具有排便次数多且较急的特点，且大便状态也会变得异常，可呈现出大便溏稀、颜色较浅和粪便量少等诸多特征，往往会夹杂有少量粘液或脓血。另外，不少患者可出现发烧腹痛等全身性反应，还会并发营养不良和中毒性肝炎。

慢性腹泻的常见并发症为营养不良和维生素缺乏症，与长期性大便次数增多和营养流失有关。同时会导致抵抗力下降，而出现真菌性肠炎一类继发性感染疾病。部分患者可能会并发中毒性肝炎，还可有电解质紊乱及肠出血的可能性，严重时会导致肾衰竭。