对于尿道分叉，并非所有患者都必然是由疾病引起的，其中大多数是生理原因。生理性尿道分叉大多与疾病无关，主要是由于前尿道或尿道开口处的暂时阻塞，这种情况在早上第一次排尿时更有可能发生。病理性尿分叉与某些疾病有关。长期尿分叉主要是由于后尿道或尿道口严重狭窄或慢性炎症，一些分泌物在尿道口堵塞，导致尿液不能顺利排出。常见的有急性尿道炎、前列腺炎等疾病。