输精管堵塞的原因多种多样，先天性输精管短如自然导致无输精管，精子在附睾内受阻，包括一些病人的附睾体部分和尾部也短如，那完全是在附睾头部受阻。也有一些人以前做过输精管切除术，这肯定是一个障碍。最常见的是附睾炎，因为炎症引起附睾尾部瘢痕，导致精子在附睾头部和底部淤积。