小儿慢性腹泻的病程一般会持续两个月左右，还有的患儿可能不会持续性的腹泻，但每次发作间隔时间都在两到四周不等。患儿每次病情发作时，都会表现为大便次数增加、大便性状稀薄，且伴随有腹痛、肚脐胀痛的症状。而导致慢性腹泻病程延长的原因，主要是原发病未能及时控制有关。

导致小儿发生慢性腹泻的原因主要是因为肠道菌群失衡，因为新生儿菌群尚未形成，如果在受到细菌、病菌和真菌等多种致病菌感染后，滥用抗生素的话，就容易引起慢性腹泻。另外，长期营养不良、乳糖不耐受和喂养不当的话，也容易造成小儿出现慢性腹泻的情况。

慢性腹泻会引发的并发症之一就是感染，除了一般的感染之外，还包括真菌感染，甚至是全身性的真菌病。再就是会出现营养不良以及维生素缺乏症，这也是慢性腹泻常见的并发症之一。除此以外，慢性腹泻的并发症还包括病毒性心肌炎以及中毒性肝炎。

出现慢性腹泻症状时，可以服用西药进行治疗，比如用益生菌调理肠道菌群，用蒙脱石散、诺氟沙星胶囊等止泻；也可以辨证服用中药治疗，比如黄连素、加味胃苓汤、参苓白术散等，都可以起到不错的止泻效果。

慢性腹泻和急性腹泻的发病原因、症状表现、发病时长，以及治疗方法都有所不同。慢性腹泻的病因比较复杂，可能是因为疾病或受到了感染所造成的，如果不及时治疗，可能会出现营养不良的情况，且发病时间较长，在治疗上需要根据病因针对性处理。急性腹泻主要是因为吃了不干净食物所造成的，发病时间比较短，患者容易出现发热的症状，需要使用一些调节水电解质的药物。