丙型肝炎的并发症主要包括：丙型肝炎容易诱发内分泌疾病，如糖尿病，也容易伴有甲状腺功能的改变。常见的甲状腺功能异常包括甲状腺功能减退、甲状腺机能亢进、桥本氏病、抗甲状腺抗体升高、自身免疫性甲状腺炎等。丙型肝炎容易诱发肝性脑病，这是最常见的死亡原因。丙型肝炎容易诱发肝硬化和肝癌。丙型肝炎是肝硬化的主要原因，也是肝癌的主要致病因素。