生理因素是造成内分泌失调的主要原因。人体的内分泌腺有自我调节功能，可以使人保持生理的动态平衡，但内分泌腺的这些自身调节功能一般会随年龄的增长而下降，从而导致内分泌失调。有些人的内分泌失调是来自于遗传。几乎所有的垂体激素的节律都与睡眠和昼夜节律有关，因此失眠、长期熬夜、昼夜颠倒的人群极易发生内分泌失调。