女性全身性疾患如重度营养不良，或是饮食中缺乏某些重要的营养因素都可以影响卵巢功能而不孕。慢性疾病、代谢性疾病例如甲状腺功能低下或亢进、糖尿病、肾上腺功能紊乱等也能导致不孕。卵巢局部因素，如先天性无卵巢或是幼稚性卵巢、卵巢功能早衰、多囊卵巢、某些卵巢肿瘤如颗粒-卵泡膜细胞瘤、卵巢母细胞瘤等能够影响卵巢激素分泌及排卵。