癫痫预后与癫痫的病因是密切相关的。癫痫病因分为：遗传性的因素、结构性的因素、代谢性的因素、免疫性的因素和原因未明的。少部分癫痫例如BECT失神发作的儿童。大部分是一种遗传性的癫痫，随着儿童生长发育，多数儿童在青春期后癫痫是可以治愈的。但是部分男性癫痫、癫痫性脑病患者，由于脑部结构发育时间异常，遗传代谢性的疾病等会导致癫痫预后比较差，有时需通过用药来控制，甚至部分患者通过药物都很难控制儿童癫痫发作。