导致小儿发生慢性腹泻的原因主要是因为肠道菌群失衡，因为新生儿菌群尚未形成，如果在受到细菌、病菌和真菌等多种致病菌感染后，滥用抗生素的话，就容易引起慢性腹泻。另外，长期营养不良、乳糖不耐受和喂养不当的话，也容易造成小儿出现慢性腹泻的情况。

慢性腹泻会引发的并发症之一就是感染，除了一般的感染之外，还包括真菌感染，甚至是全身性的真菌病。再就是会出现营养不良以及维生素缺乏症，这也是慢性腹泻常见的并发症之一。除此以外，慢性腹泻的并发症还包括病毒性心肌炎以及中毒性肝炎。

当出现慢性腹泻时，西医上会建议用肠炎宁片等止泻药、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等肠道微生态制剂止泻；必要时应用补液盐防止脱水。中医上可辨证服用胃苓汤加减、葛根岑连汤加减、痛泻要方加味等中药治疗；也可以选择推拿按摩的方法止泻。

慢性腹泻患者可以进行实验室检查、影像学检查、黏膜活组织检查、大便常规检查、纤维肠镜检查、胃镜和小肠镜检查等等。通过这些检查方法，能够有效的判断慢性腹泻的严重程度以及病变部位，然后结合检查结果，制定最合理的治疗方案，其中纤维肠镜检查是最全面且最直接的一种检查方法。

对于患上了慢性腹泻的人来说，在日常的饮食当中，要忌性质寒凉的食物，比如说柿子和螃蟹；再就是要忌辛辣刺激性的食物，这些食物会刺激肠胃，加重腹泻和腹痛的症状。除此以外，慢性腹泻患者也要忌脂肪含量高的食物、粗纤维食物以及坚硬不容易消化的食物。