会引起射精后疼痛的疾病有附睾炎、附睾囊肿、附睾肿瘤等。发生这些疾病要到正规医院检查，然后对症治疗。精索静脉曲张，多数都是由于精索内部静脉丛发生了异常扩张引起的，这种疾病科导致男性睾丸功能出现减退，不仅会有射精疼痛、射精障碍等表现，严重的还会引起男性不育。