牙根囊肿在一般情况下是不会发生癌变的，从牙根囊肿的本质上来讲是一种良性的频频反应，甚至都不会发生恶变，那么从牙根囊肿出现癌变的概率方面来讲的话简直是微乎其微，牙根脓肿形成的生理机制也只是与牙根部位有关系，并不会发生癌变。