有些卵巢囊肿是不影响怀孕的。卵巢囊肿的种类有很多，对于卵巢的生理性囊肿，也就是指在月经后半期由于排卵后形成的黄体囊肿。这种情况下是由于卵巢分泌的激素所形成的生理性囊肿，不影响生育，反而说明卵巢的功能正常，可以正常分泌雌孕激素。在月经之后囊肿往往会自行的消失。对于卵巢的炎性囊肿有可能会造成对生育的影响。由于细菌或者衣原体从生殖道的入侵，上行感染，导致盆腔和腹腔的继发性感染，炎症导致的渗出和纤维化，将输卵管和卵巢粘连包裹形成炎性包块。卵巢的炎性肿物一般不会单独存在，可能会合并有输卵管卵巢脓肿，输卵管导致粘连，堵塞，这种情况下会影响受精卵的运行，造成输卵管性不孕。另外就是子宫内膜异位囊肿。