慢性腹泻的病程一般是两个月以上，如果连续两个月都出现了腹泻的症状，可以被称为是慢性腹泻；除此之外，如果腹泻发作的时间不长，但是在一年内累计发作超过了三个月，也可以被称为慢性腹泻。如果在这期间出现的食物中毒、消化不良或肠道疾病，就可能会使慢性腹泻的病程延长。

出现慢性腹泻后可以吃磺胺类药物，该类药物有很好的止泻疗效，不过服药时最好遵听医嘱。如果腹泻情况比较严重，则可以应用吸附性止泻药。另外，因细菌、真菌引起的慢性腹泻，可服用抗生素来抑菌杀菌，达到治疗目的。而中药上可以服用人参健脾丸、六君子丸、附子理中丸等中成药来治疗慢性腹泻。

慢性腹泻患者需要忌吃含油脂过高的食物，所以在烹饪菜肴时，要控制好植物油的用量，尽量以蒸、炖的方式制作。另外，也要限制高蛋白食物的摄入，且少吃会促排便的高纤维食物，以及会对肠胃造成刺激的辛辣刺激食物，这样才能让慢性腹泻更快恢复。

慢性腹泻患者在日常生活中可以多喝白粥，适当的吃一些水果，尤其是苹果和石榴，还应该多吃容易消化的食物，例如面食，但是在制作的过程中不要煮得太过于油腻和辛辣，否则会加重肠胃复担。除此之外，还可以制作栗子粥和菱粉粥，对治疗慢性腹泻有很好的辅助效果。

慢性腹泻的主要危害之一是会导致肠道菌群失调，可诱发真菌性肠炎、肠出血等多种大肠疾病，严重时可能会导致肠穿孔。同时会因为长期性腹泻而出现免疫力下降的情况，且会因此而发生继发性感染。除此之外，还会引起营养不良和肝肾功能异常。