1.一次性切开法：此法适用于低位单纯性肛周脓肿。脓肿搏动最明显处作一放射状切口，排出脓液，以食指或血管钳分离脓腔纤维间隙，另一食指伸入肛内做引导，将球头探针探入脓腔仔细寻找内口，发现内口后，将探针从肛腔内引出，沿探针切开脓腔壁，并且延长切口至其最高点，修剪肛外创口呈梭形切口，使引流通畅。凡士林纱条填塞伤口。
2.切开挂线法：适用于单纯性高位脓肿。于脓肿搏动最明显处做一放射状切口，排出脓液，以食指分离脓腔，另一食指伸入肛内做引导，探针探入脓腔，内口从直肠环上最薄处穿出，引10号丝线于肛外收紧结扎。
3.多切口引流：此法适用于肛管后间隙脓肿或直肠后间隙脓肿合并单侧，双侧坐骨直肠间隙脓肿或骨盆直肠间隙脓肿。手术时在对应处行放射状切口，对原发病灶予以切开或挂线。