多囊卵巢综合症的治疗一般可分为药物治疗和手术治疗两大类，药物治疗是主导。药物治疗可以口服降低高雄激素血症的药物，例如服用避孕药、糖皮质激素、或是安体舒通和孵化酰胺等，也可服用促排卵药物治疗，例如氯米芬、来曲唑和促性腺激素。当然也做手术治疗，例如双侧卵巢楔形切除术、腹腔镜下进行卵巢电焯或是激光打孔治疗等。