慢性肾功能衰竭可以针对原发病进行治疗，关注慢性肾衰竭的并发征分别的给予不同的治疗方案。
慢性肾功能衰竭可以有多种原因疾病引起，就是慢性肾脏病，最终的话很多疾病都会像慢性肾功能衰竭的方向发展。
原发病比如，慢性肾小球肾炎要积极控制血压，减少蛋白尿。糖尿病肾病要很好的控制血压、控制血糖、控制血脂。继发性肾小球疾病，比如狼疮性肾炎要很好的控制狼疮的活动，高血压肾损害要很好的控制血压。出现并发征，比如出现了肾性贫血，要积极纠正贫血，用促红素、用铁剂。出现了钙磷代谢紊乱，要纠正低钙、高磷的状态，比如，用一些含钙的磷结合剂或者非含钙的磷结合剂。出现甲旁亢，要根据钙磷的情况和甲状膀腺的水平，给活性维生素d的治疗。