女性卵巢巧克力囊肿在药物治疗或者是手术治疗后容易引起不孕症的。如果出现不孕，需要针对引起不孕的具体原因来进行治疗。如果是卵巢巧克力囊肿引起输卵管不通所影响怀孕，可以选择药物或者手术治疗来疏通输卵管。因为输卵管不通，大多是由于炎症造成的，可以给予抗炎的药物或者中成药物来进行治疗，必要时也可以进行理疗。治疗后可以在月经干净后，进行输卵管的通水（检查）。如果是由于卵巢功能损伤所引起的排卵障碍，那么则需要进行促排卵治疗，可以进行药物治疗，效果也是比较良好的；如果经过药物或者手术治疗效果都欠佳，可以采取辅助生殖技术来帮助怀孕，这样女性能够早日怀孕的。

巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种常见类型，跑出子宫腔的异位内膜在卵巢生长，形成囊肿。既然是内膜，即使不在子宫腔，它也会受到月经周期雌孕激素波动的影响，来一次月经，就长一点。然后脱落的内膜又不能像月经一样排出，只能呆在囊肿里，越积越多。这些陈旧性的出血，样子类似巧克力液，所以俗称巧克力囊肿，学名是“卵巢子宫内膜异位囊肿”。巧克力囊肿的主要症状是痛经、不孕和盆腔包块。如果巧克力囊肿比较大，可能发生破裂，引起剧烈腹痛，需要急诊手术治疗。巧克力囊肿，药物治疗通常是不敏感的，手术治疗是首选的治疗方法。巧囊和卵巢子宫内膜样癌，透明细胞癌之间的关系密切，巧克力囊肿恶变率约为1％，手术可以除外巧囊恶变，或者避免夜长梦多，避免时间久，病程长，囊肿性质的变化。

巧克力囊肿和卵巢囊肿的区别，我们要先搞清楚，巧克力囊肿到底是什么性质的囊肿？巧克力囊肿一般认为是一个子宫内膜异位症，病灶种植到卵巢，随着每次来月经，异位病灶出血，逐渐出现陈旧血液的沉积、包裹，从而形成了巧克力囊肿。开始可能只是一个子宫内膜异位病病灶，随着时间的延长，每次月经的来潮慢慢的形成了囊肿，慢慢的长大。有一部分病人表现为痛经、不孕、同房痛、腹痛，没有症状的时候她可能不来检查，有症状了来做个B超，发现有一个囊肿，和普通的单纯的卵巢囊肿的区别在于哪儿呢？区别在于巧克力囊肿的囊液不是透亮的，是很密集的光点。单纯性囊肿囊液是很透亮的，是一个暗区；另外，这部分人痛经是比较明显的，而单纯性囊肿可能没有任何症状，不痛，也不痒，什么症状都没有，只是说常规体检做B超才发现的。另外，我们常规做妇科检查，巧克力囊肿这部分病人因为每次来月经都会在囊肿周围形成粘连，这部分病人的囊肿是比较固定的，甚至有些人阴道检查的时候，她有一个痛点，而单纯性囊肿她基本上没有太明显的粘连或者疼痛的产生。

巧克力囊肿有什么反应，一般来讲小的卵巢的巧克力囊肿患者没有任何不适，大概不到百分之三、四十的患者可能会出现痛经或者是下腹不适或是会有疼痛。但是当囊肿长到了一定程度，大于6、7公分的时候，可能局部会有压迫的症状，患者会有尿频的感觉，或者是肛门下坠的感觉，老想上厕所但是又拉不出来。当囊肿长到一定程度，它可能会出现破裂，一旦破裂患者就会有剧烈的腹痛，有剧烈的不适，那么在这时候，患者应该紧急就诊。此外有些不孕症的患者她因为不孕到医院来就医，那么在常规的检查中发现卵巢有巧克力囊肿，那么这时候它的反应就是一个不孕的表现。总而言之，卵巢的巧克力囊肿一般来讲是没有什么症状，但是当它长到一定程度的时候，会有压迫症状或者会出现破裂或者会导致不孕，那么当患者出现了肚子疼或者不孕的时候，或者有腹部下坠的时候，到医院就诊的时候医生可能考虑会有这些方面的异常，所以就建议患者去做一个妇科的B超，这时候就会发现，可能会出现一个卵巢的巧克力囊肿。

巧克力囊肿患者服用药物前，首先应明确巧克力囊肿性质，再选择合适药物治疗。浆液性囊腺瘤或粘性囊腺瘤，药物治疗无效。卵巢子宫内膜异位囊肿，可借助激素类药物抑制月经来潮，以此达到防止囊肿出血、继续长大的目的。也可借助中药治疗卵巢子宫内膜异位囊肿，其对患者并发痛经症状作用效果较好，但对囊肿增长抑制作用不大。一、浆液性囊腺瘤或粘性囊腺瘤，药物治疗无效；二、卵巢子宫内膜异位囊肿，可通过药物治疗，控制继续生长。但对于已经长出的囊肿，服用药物无法促使其消退，可用激素类药物抑制月经。一般只要不来月经，囊肿就不会出现继发出血以及变大。若月经正常来潮，囊肿继续长大可能性很大。有些中药也可治疗卵巢子宫内膜异位症，但中药对于缓解卵巢巧克力囊肿导致的痛经，效果比较好，对控制卵巢囊肿继续长大效果较差。