乙肝核心抗体阳性有两种意义，一种是乙肝核心抗体阳性，但IgM抗体水平较低，表示以前感染过乙肝病毒，现已康复；另一种是乙肝核心抗体阳性，IgM抗体水平也较高，表明体内有乙肝病毒存在，且乙肝病毒正在复制，有传染性，此情况需要抗病毒治疗。
乙肝核心抗体包括乙肝核心抗体IgM和乙肝核心抗体IgG，常用竞争法检测。HBV感染后，在多数人血清中能检出此抗体，是一种敏感的血清学标志。乙肝核心抗体阳性表示曾经感染过HBV，这是一个永远的标志，即只要曾经感染过乙肝病毒就会存在。但在实际检测中，由于不同时段，核心抗体在体内的水平不同，或者在不同医院检查，仪器和试剂之间的误差，有时呈"阴性"。
但从医学理论上讲，核心抗体是一个标志性抗体。乙肝核心抗体阳性要和表面抗原、E抗原在一起分析才有临床意义，单独核心抗体阳性，只能说感染过HBV，但没特别的临床症状。临床上，大三阳，小三阳，都不一定有症状，主要看肝功能，肝功能有问题才可能会出现临床症状，如黄疸，消化不良等。
单独分析乙肝核心抗体一般不会有太大的意义，要和其几项一起分析，如果表面抗原、e抗原和核心抗体同时呈阳性，表示乙肝大三阳；如果表面抗原、e抗体和核心抗体同时呈阳性，表示乙肝小三阳。