新生儿肺炎是由于新生儿感染病原菌，或者是吸入的一些物质，导致肺部发生的炎症病变。
新生儿肺炎根据病因的不同，分为新生儿吸入性肺炎和新生儿感染性肺炎。新生儿由于吸入羊水、胎粪或者是乳汁，引起的肺部化学性炎症反应，或者继发的感染，称为新生儿吸入性肺炎。新生儿感染性肺炎分为产前在宫内发生的感染性肺炎，在生产过程当中发生的感染性肺炎，出生以后发生的感染性肺炎。
细菌感染是以革兰氏阴性杆菌多见，还有B族链球菌、沙眼衣原体、解脲脲原体以及巨细胞病毒等等。产后感染伴有呼吸道感染者直接接触婴儿，将细菌或病毒传染给新生儿，脐炎、皮肤感染和败血症，病原体通过血行传播到肺而引起肺炎。
病毒是呼吸道合胞病毒、腺病毒比较多见，有柯萨奇病毒或者解脲脲原体、衣原体可以导致新生儿肺炎。
羊水吸入是胎儿在宫内或者分娩过程当中吸入大量的羊水，跟羊水吸入的多少是有关系的。胎粪吸入性肺炎是宫内或者生产的过程中，吸入混有胎粪的羊水，是产前或者产时发生吸入性肺炎，多见于足月儿或者过期产儿。乳汁吸入性肺炎是在哺乳的过程当中，乳汁吞咽到呼吸道，或者误吸到呼吸道，引起了窒息，引起的呼吸困难，所导致的肺炎，称为乳汁吸入性肺炎。