肛瘘的主要鉴别诊断是患者近期是否出现红肿，热痛等现象，一般肛瘘患者都会有肛周脓肿的病史的。通过肉眼可看到肛周皮肤上有外口，常常出现为单个，表现为红色乳头状突起，用手按压可以出现脓性分泌物有或带血的分泌物。而肛门流脓、流粪是最主要的表现,其他肛肠疾病是不会出现的。因分泌物的刺激，有时候患者会觉得有瘙痒感。在触诊时可发现皮下有条索状肿物向肛门方向，并且在齿状线有相应部位出现瘘口是最典型的临床症状。治疗时最好的方式就是手术治疗。

复杂性肛瘘最主要的特点是会反复性发作，并且是在多个管道或外口处存在的，一般复杂性肛瘘的症状都比较重，有时患者吃一些消炎药感觉好了，过一段时间又开始发作，这种反复发作的情况是反复性肛瘘的主要症状。主要的表现会有流脓流血，脓血流出来的时候表现为无痛症状，脓血流不出会表现出剧烈的疼痛，会出现很多个瘘管的肿痛和流脓症状。肉眼可见有条索状肿块并且用手触摸可触摸到，通常是在肛门内，如果反复发作的话，肿块会越来越大，条索状会越来越多。

肛瘘作为临床上直肠肛管非常常见的良性疾病。主要的发病原因是坐骨直肠肛管周围间隙感染。在临床上肛瘘其实与肛周脓肿是同一种疾病的不同分期，也就是说两者的根本发病原因都是因为，坐骨直肠肛管周围间隙软组织的细菌感染，感染的细菌主要是肠道内的细菌。主要是革兰氏阴性杆菌以及厌氧菌，急性期在临床上称为肛周脓肿，慢性期因为迁延不愈，通常包含有内口，外口以及窦道，所以称为肛瘘绝大多数。绝大多数肛瘘的发生是因为肛周脓肿急性期行脓肿切开以后，迁延不愈而形成的，通常需要再次行手术治疗，一般采用挂线治疗，避免一次性的手术切断肛门括约肌，而引起大便失禁的症状。所谓复杂性肛瘘，是指有多个内口，或者是多个窦道，难以一次手术成功的肛瘘，对于复杂性肛瘘，通常需要行两次以上的肛瘘挂线，才能获得临床的治愈。

低位肛瘘，同样属于肛瘘的一种。肛瘘主要是继发于肛周脓肿行脓肿切排以后。形成的坐骨直肠周围间隙慢性感染形成的窦道，解剖学上来说分为内口外口与窦道。所谓的低位肛瘘也就是指整个肛瘘位于肛管直肠环的下方，内口一般来说开口于齿状线的下方，因为仅仅位于皮下粘膜层，粘膜下层。而与肛管直肠环没有相关性或者说不穿过肛管直肠环，对于低位肛瘘，临床治疗上通常采用局部麻醉或者是硬膜外麻醉，或者是腰麻、甚至全麻，将肛瘘连同窦道一次性的完整的梭形切除，全面敞开，术后以1比5000高锰酸钾坐浴。局部涂以痔疮膏，或者油性的比如凡士林软膏。同时饮食上避免进食油腻辛辣刺激食物，多进食新鲜的蔬菜水果等高纤维素食物，保持大便通畅，通常1~2周左右，就可以获得治愈。

手术前肛瘘有点出血，不用害怕。做完术后，术后换药时出血多要去医院做检查，出血再多要做二次手术，行止血术治疗。肛瘘出血，不用害怕。痔疮出血是一个痔静脉充血、破溃，出血量会很高、很大，出血50毫升甚至于100毫升以上，肛瘘的出血由于瘘管破溃而出血，主要是以脓为主。肛瘘出血是因为窦道感染出血，出血很少，出血的几率比出脓的几率低，即便是出血也是脓加着血，出血量很低。肛瘘做完手术，出血多是做手术时，电刀止血有结痂脱落，出血就会危险。