阴茎有异味，原因最多的是由于包皮过长或者包茎包皮垢的味道。包皮垢主要是由于龟头或者包皮的感染，或者尿液的聚集造成尿的异味。对于阴茎有异味，还有一些情况是由于其他原因的细菌感染，或者真菌的感染都可以出现阴茎的异味。
出现了阴茎异味，首先观察要看阴茎黏膜有没有变化，如果没有新生物的产生在阴茎上，同时也没有异常的分泌物，出现这种异味，就建议可以用清水进行清洗，就可以把异味问题解决。对于阴茎尤其龟头是一个比较敏感的部位，而且龟头和阴茎的包皮内板都是黏膜，所以不建议用常规的清洗液，包括香皂、肥皂、沐浴液、洗发水都不建议来进行会阴区的清洗。清洗包皮、龟头，最好的办法就是清水。对于特殊的感染情况一定要用适合于清洗黏膜的药物进行清洗，这样才能有效地抑制炎症进一步发展，炎症进行控制。同时就可以把阴茎的异味，也会得到一个相应的治疗。
还有一种情况，最常见的情况就是包皮过长，这些患者如果长期出现阴茎的异味，建议也做一个包皮环切手术，这也是一个比较小的手术，在医院基本上在门诊就可以完成，现在随着技术的进步，包皮环切手术是越来越常规的一个手术，而且创伤越来越小，现在有各种的吻合器，也不像过去需要包皮的内外板一圈的缝合，切割和缝合基本上一次性就可以完成，就可以把包皮进行环切。
所以阴茎有异味最好到医院去查一下是不是有感染，或者是有一些其他原因的器质性疾病，或者甚至有一些早期的阴茎癌，晚期的阴茎癌，也可能会出现异味。到医院去进行就诊，大部分都是没有太大问题，但是最好还是到医院进行相应的检查来明确。