射精后不舒服可能由多种原因引起，常见的病因有过度疲劳、长时间无性生活、尿路感染、性器官结构问题、淋病等。

1.过度疲劳：长时间性活动、频繁性行为或身体疲劳可能导致射精后不适感。休息和恢复通常可以缓解这种不适感。

2.长时间无性生活：如果长时间没有性活动，射精后可能会感到不适，这通常是由于生殖系统在持续性兴奋状态后突然释放的原因。

3.尿路感染：射精后不舒服可能是尿路感染的症状之一。这种感染会导致尿意频繁、尿痛、膀胱充盈感和射精后不适感。

4.性器官结构问题：某些性器官的结构问题，如精囊淤留、射精管阻塞等，可以导致射精后的不适感。

5.淋病：是由淋病奈瑟菌感染所引起的一种常见疾病，主要表现为泌尿生殖系统黏膜的化脓性炎症，可能导致射精后不适感，也会伴随其他症状，如疼痛、溃疡、瘙痒等。

如果射精后不适感持续存在或症状严重，建议咨询医生进行评估和诊断。医生可以通过详细的病史询问、体格检查和必要的辅助检查来确定具体病因，并制定相应的治疗方案。