十二指肠憩室病患者在治疗方法，主要是进行抑酸治疗以及抗菌治疗。在基本治疗期间，患者需要保持规律的饮食以避免过度劳累导致疾病恶化。然后使用抑酸药物，以减少胃肠道中酸性物质对十二指肠粘膜的损害，从而促进炎症性粘膜的恢复。没有明显症状的十二指肠憩室患者可以服用质子泵抑制剂亦或者H2受体拮抗剂药物。