鼻咽恶性肿瘤的病因尚不清楚，但可以从遗传因素、病毒因素、环境因素等方面找到一些线索。
1.遗传因素：该病具有一定的种族易感性和家庭聚集性，并与免疫遗传标志有关。
2.病毒因素：主要是EB病毒。自EB病毒被发现后不久，在鼻咽恶性肿瘤患者的血清中发现EB随着病情的发展，病毒的抗体滴度增加；淋巴细胞从癌症活体组织中培养出来的病毒与鼻咽恶性肿瘤有关。EB病毒研究已成为探索鼻咽恶性肿瘤病因的重要方面。
3.环境因素：多环烃、亚硝胺、微量元素镍等多种化学物质与鼻咽恶性肿瘤的发生有关。在动物试验中发现维生素A鼻咽粘膜对致癌物质的敏感性，如缺乏和性激素失调。
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