肛瘘形成的主要原因有以下几点:第一、肛周脓肿破溃或切开排脓术后,脓液排出脓腔,逐渐缩小,外部破溃口和切口也缩小,脓腔形成结缔组织增生的坚硬的管道壁,因而不能够自然愈合。第二、肛瘘是一种感染性疾病,当免疫力下降,肠道的病菌从肠道的肠屏障突破进去,进入到肛门直肠周围引起感染,如:白血病、艾滋病、糖尿病,如果过度的疲劳、熬夜或者是食辛甘厚腻制品,辛辣刺激制品也会造成肛瘘的发生。第三、肠道的菌群失调,长期腹泻、滥用抗生素、肥胖等原因。第四、肛门、直肠的损伤,肠道细菌经过肠道损伤的破口进入到肛门周围也会引起肛瘘。第五、手术,一般讲在内痔注射术时,如果注射过深进入到了基层也会产生局部的感染,而产生感染后也会导致肛瘘的形成,还有产后的会阴缝合以及前列腺尿道的手术都会导致肛瘘的发生。第六、肛裂,如果肛门反复感染就会出现皮下瘘,最严重的三期肛裂合并有皮下肛瘘。第七、还有结核、克罗恩病、溃疡性结肠炎、肛管或者肠癌以及腹股沟淋巴结肉芽肿,这些疾病也会形成肛瘘。