眼睛里有黑色的斑点有以下几种可能的原因：
第一，结膜部位色素沉着造，这种情况下出现的黑色斑点是比较平坦，没有隆起的结节，也不会有血丝，色素沉着的道理和皮肤色素沉着发生的原因是有共性的，一般是和长期的风吹日晒有关系，紫外线照射、风尘的刺激等都可能引起结膜的变性，多见于从事长期户外工作的人群；另外高血脂、冠脉粥样硬化的老年人，体内脂质沉积，也可能造成白眼珠部位的色素沉着，这种情况下一般并不会影响视力，所以不需要进行治疗。
第二，眼睛有黑色斑点可能是玻璃体混浊所引起。正常的玻璃体是呈凝胶状态的，代谢比较缓慢，但是不能再生，随着年龄的增长，玻璃体容易发生液化和后脱离的情况。在玻璃体出现病变之后，患者可以看见眼前有小黑影儿漂浮，随着眼球的运动，黑影也会发生运动，也就是临床上所称的“飞蚊症”，这种往往较常见于高度近视的患者，也可能是外伤之后引起。
第三，色素痣，结膜的色素痣是比较少见的，有一定的遗传倾向，这种色素痣的大小一般比较稳定，不需用进行处理，定期随访观察即可。但是有一些结膜色素痣如果生长加速，边界不清，或者伴随出血、破溃、甚至疼痛等症状时，有可能是发生了恶变，此时需要及时到医院进行治疗，必要时行手术切除、病理检查来明确诊断。