引起鼻窦炎的原因有细菌感染，病毒感染，同时与过敏性鼻炎、霉菌性鼻窦炎和鼻腔结构也有关。
1、细菌感染是较常见鼻窦炎原因。细菌感染性鼻窦炎，患者出现持续的流黄色脓性鼻涕。如果没有及时用药，可持续10天以上。这种情况也同时说明需要使用抗生素治疗。
2、病毒感染。比如感冒后可能引起鼻窦炎，就属于和感冒病毒感染有关系的鼻窦炎。这种情况在一周左右可自愈，也不需要使用抗生素。
3、和过敏性鼻炎有一定的关系。有的鼻窦炎是继发于过敏性鼻炎，时间长了或者过敏性鼻炎较重的时，导致了鼻窦黏膜肿胀，堵塞鼻窦的窦口，从而导致鼻窦内分泌物存留，是属于过敏性鼻炎导致的鼻窦炎，也是过敏性鼻窦炎。
4、霉菌性鼻窦炎。主要和霉菌感染引起鼻窦炎有关系。表现为鼻窦内有霉菌团屯留，需要手术治疗。
5、鼻窦炎和鼻腔结构有关系。比如有的人鼻中隔偏曲导致鼻塞，从而导致鼻窦的引流变差，导致鼻窦炎。